Colossal Biosciences presentó GenoMorph, una plataforma de IA que combina genómica comparativa, datos de desarrollo y modelos 3D para orientar la búsqueda de rasgos del dodo. La empresa afirma haber identificado unos 2.300 posibles objetivos de edición, que todavía debe evaluar en laboratorio.
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- GenoMorph busca genes relacionados con la forma del cráneo y el pico del dodo, pese a que Colossal afirma contar con un solo genoma de esa ave.
- La plataforma señaló unos 2.300 posibles objetivos de edición; la compañía también desarrolla una forma de probar cambios en embriones de aves.
- Colossal reportó una colonia de 36 palomas de Nicobar y anunció que Peter Diamandis creó una firma para respaldar empresas vinculadas con su plataforma.
🧬🚨 Colossal usa IA para buscar rasgos del dodo
GenoMorph identificó unos 2.300 posibles objetivos de edición genética, aún pendientes de pruebas de laboratorio.
La empresa afirma contar con un solo genoma del dodo. No ha recreado el ave. pic.twitter.com/n0AkbUIdTB
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Una herramienta para trabajar con pocos datos
Colossal Biosciences anunció GenoMorph, una plataforma de inteligencia artificial que busca acelerar su trabajo de desextinción mediante el análisis de datos genéticos y rasgos físicos de aves. La compañía explicó a TechCrunch que el sistema combina morfología 3D, genómica comparativa y biología del desarrollo para señalar genes que podrían investigarse cuando la información genética de una especie extinta es limitada. La herramienta no edita el ADN por sí sola, sino que ayuda a orientar la búsqueda de posibles cambios.
El proyecto del dodo muestra por qué Colossal considera útil ese enfoque: la empresa afirma trabajar con un solo genoma de esa ave, mientras que en su proyecto del mamut lanudo ha reunido 100. La diferencia, según la compañía, tiene que ver con la conservación del ADN en los ambientes donde vivieron ambas especies. El frío de las regiones habitadas por el mamut preserva mejor el material genético que los trópicos asociados con el dodo, lo que deja a los investigadores con menos genomas completos para comparar en este último caso.
La comparación entre muchos genomas suele permitir a los científicos buscar diferencias asociadas con determinados rasgos, explicó Ben Lamm, director ejecutivo y cofundador de Colossal. Sin una colección amplia de muestras antiguas, esa vía de análisis resulta más restringida, porque el equipo debe trabajar con una cantidad reducida de información genética. GenoMorph intenta compensar ese límite al incorporar datos sobre el desarrollo de aves actuales y relacionarlos con sus características anatómicas, en vez de depender únicamente de comparaciones entre genomas de la especie extinta.
Para construir la plataforma, Colossal reunió datos de desarrollo de pollos, codornices, patos y palomas, junto con información genética y mediciones tridimensionales de cráneos de más de 70 especies de aves. Lamm dijo que desarrollar el sistema requirió más de un año de trabajo y que también aprovecha los conocimientos acumulados por la empresa en sus iniciativas de desextinción. La combinación permite al equipo examinar cómo se forman estructuras como el pico y el rostro durante el desarrollo de distintas aves.
De las predicciones a las pruebas de laboratorio
Según Lamm, la IA aprende qué regiones del ADN se activan mientras distintas aves desarrollan sus picos y estructuras faciales. Con esos patrones, GenoMorph busca predecir qué interruptores genéticos podrían haber contribuido a la apariencia característica del dodo, una hipótesis que la empresa deberá comprobar. El directivo describió la herramienta como un mapa para el genoma de esta ave: en lugar de explorar una gran cantidad de diferencias posibles sin orientación, el equipo puede concentrarse en las que el sistema considera más prometedoras.
Colossal afirmó que ha identificado aproximadamente 2.300 objetivos prometedores de edición de ADN relacionados con la morfología craneofacial del dodo. La cifra representa candidatos para probar, no cambios ya aplicados ni rasgos que la empresa haya logrado reproducir en un animal. Lamm señaló que reconocer qué modificaciones podrían distinguir a una especie extinta es uno de los principales cuellos de botella de estos proyectos, pero también advirtió que hace falta comprobar si las ediciones producen los efectos físicos buscados.
Para avanzar en esa evaluación, Lamm dijo que la compañía desarrolló un sistema con nanopartículas lipídicas para llevar herramientas de edición genética directamente a embriones de aves en desarrollo. La propuesta permitiría observar cómo ciertos cambios influyen en el desarrollo sin esperar un ciclo reproductivo completo hasta que las aves alcancen la madurez sexual. De acuerdo con la explicación de la empresa, este método busca acelerar la fase de prueba, aunque el anuncio no informa resultados de ensayos que confirmen todavía las predicciones de GenoMorph.
La compañía también comunicó que su colonia de palomas de Nicobar cuenta ahora con 36 aves y que consiguió crear las células esenciales que dan origen a óvulos y espermatozoides. Colossal considera relevante ese avance porque identifica a la paloma de Nicobar como el pariente vivo más cercano del dodo. Según Lamm, esas células forman una parte fundamental de la estrategia de la empresa para crear aves que porten rasgos del dodo, aunque el anuncio no afirma que ya haya producido animales con esas características.
Validación, cautela y nuevos apoyos
El paso siguiente que Colossal espera dar es demostrar en el laboratorio lo que GenoMorph predice sobre los rasgos del dodo. Lamm sostuvo que varias tecnologías desarrolladas por la empresa empiezan a converger y que podrían servir a proyectos distintos, incluso en otras ramas del árbol de la vida. Por ahora, esa convergencia describe la expectativa de la compañía: el anuncio detalla herramientas, candidatos genéticos y avances con células, pero no presenta un dodo recreado ni una prueba de que los objetivos identificados ya produzcan el resultado buscado.
Ante una pregunta sobre la seguridad de editar genes de esta manera, Lamm respondió que el propósito de GenoMorph es hacer que la ingeniería genética sea más precisa, controlada y comprobable. También recalcó que la plataforma no realiza las ediciones, sino que ayuda al equipo a decidir qué cambios vale la pena investigar. Identificar una posible modificación, añadió, no significa introducirla inmediatamente en un animal ni asumir que es segura; la empresa plantea la validación como parte necesaria del proceso.
La distinción importa porque una predicción computacional y una prueba biológica son etapas diferentes del trabajo descrito por Colossal. La plataforma prioriza candidatos con base en los datos disponibles, mientras que el laboratorio debe determinar si esos cambios afectan el desarrollo de la forma prevista. Lamm afirmó que una identificación más precisa puede ayudar a tomar decisiones mejor informadas, pero la compañía todavía tendrá que someter sus objetivos a pruebas antes de establecer qué modificaciones funcionan y qué efectos producen.
El anuncio llegó acompañado de una iniciativa de capital de riesgo vinculada con la tecnología de la empresa. Peter Diamandis, fundador de XPRIZE e inversor en Colossal, anunció la creación de NeoGenesis Capital, una firma destinada a respaldar empresas que utilicen la plataforma de biología programable de Colossal en salud, agricultura y conservación. El anuncio no detalla inversiones concretas ni compromisos financieros, pero presenta a la nueva firma como un posible canal de apoyo para proyectos que busquen aplicar esa plataforma en distintos sectores.
En conjunto, GenoMorph añade una herramienta de análisis a un plan que depende de información genética escasa, modelos de desarrollo y pruebas experimentales. Los 2.300 objetivos anunciados dan cuenta del volumen de candidatos que la compañía pretende evaluar, no de cambios confirmados ni de un resultado final alcanzado. La propia hoja de ruta descrita por Lamm sitúa ahora el foco en validar las predicciones en el laboratorio, mientras Colossal continúa trabajando con palomas de Nicobar y con células relacionadas con la reproducción aviar.
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